Запустить chkdsk вручную очень просто. Для начала определитесь с тем, какой раздел жесткого диска будем проверять. Для этого необходимо нажать кнопку "Пуск" –> "Выполнить" и в строке вбить следующее: 

chkdsk d: /f

где:

/f – параметр, при помощи которого исправляются ошибки на диске.

d: - раздел диска, который будем проверять.

Вместо /f можно прописать параматр /r – который ищет поврежденные сектора и восстанавливает данные. В таком случае строчка выглядела бы следующим образом:

chkdsk d: /r

Так же можно запустить проверку из командной строки, используя те же параметры ( chkdsk d: /f ) о том, как запустить командную строку можно почитать тут: Запускаем командную строку